La LPO Auvergne travaille avec les conseils généraux du Puy de Dôme et de l'Allier sur les Espaces Naturels Sensibles suivants:
E.N.S départementaux:
à l'initiative des conseils généraux,
Le Pacage (63)
Le Bec de Dore (63)
E.N.S d'initiative Locale:
à l'initiative des collectivités (communes, communautés de communes...), qui demandent la labellisation d'une portion de leur territoire et qui en assurent la gestion. Sur les sites suivants, cette gestion est déléguées à la LPO: